Vous n'avez pas compris le principe de l'année complète !
En année complète, les 5 semaines sont, certes, inclues dans la mensu, mais les congés ne sont payés qu'à leur prise, à hauteur des congés acquis;
Entre le début d'un contrat en année complète et le mois de mai suivant, tous les congés pris (donc en commun avec l'employeur) doivent être déduits car non acquis. Puis fin mai sont calculés le nombre de jours ouvrables acquis qui seront posés entre mai et avril de l'année suivante. Là il y aura certainement encore des congés non acquis à déduire (on a rarement 30 jours acquis au 31 mai la 1ère année).
Donc si pour votre contrat, il n'y a pas de congés employeur décalés par rapport aux vôtres, vous ferez une mensualisation année complète SUR 52 semaines (une mensu sur 47, 48, 49, 50 ou 51 semaines n'existe pas). Fin mai vous aurez (si commencé en avril) 5 jours ouvrables acquis + éventuellement 2 jours supplémentaires si vous avez des enfants de moins de 15 ans. Ces congés vous les poserez au début des 3 semaines de congés prévus, et vous déduirez les congés non acquis au-delà des 5 jours (si pas d'enfant, ça fait 2 semaines à déduire avec le calcul de la cour de cassation).
Fin août les parents payeront les congés acquis entre juin et août, en indemnité compensatrice de CP.