Pour calculer la déduction de salaire, je pense que vous avez appliqué la méthode de la cours de cassation.
Vous avez trouvé une somme à déduire, il suffit de la diviser par votre taux horaire brut si la déduction est en brut cela vous donne le nombre d'heures à retrancher de la mensualisation. Attention Pajemploi fonctionne en net. Pour les jours vous retranchez le nombre de jours d'absence tout simplement.
Pour les CP ils se calculent en fin de période de référence et non 10% tous les mois ,c'est illégal.