Je crois que vous avez mal compris.
Ok si vous avez fait les 2 calculs fin mai et pris le plus avantageux, mais il était à payer en juin avec le salaire de juin.
Ensuite vous ne devez payer que la mensu de juillet à mai 2019.
Si vous avez payé la totalité de ses congés en mai, et en juin rajouté 10 % à son salaire, c'est faux.
Pour la déclaration à Pajemloi, effectivement vous ne devez pas déclarer les jours réels mais les jours mensualises, et ce tous les mois, même quand vous êtes en congés ou quand elle est en congés. Et ce n'est pas grave si le montant des IE payés ne correspond pas au nombre de jours déclarés.