Si vous avez payés des congés en plus de la mensu, c'est que vous avez une mensualisation année incomplete.
Mais je signale au passage que les congés ne peuvent être payés qu'en juin au plus tôt (avec le salaire de juin). Pourquoi : parce que les congés donnent aussi droit à CP, donc il faut qu'ils soient payés au cours de la nouvelle année de référence (si le contrat avait continué, en mai 2021 vous auriez calculé les 10 % sur les salaires et congés payés entre juin 2020 et mai 2021 : là les 10 % sur les congés payés en mai 2020 risquent d'être oubliés).
Vous avez donc calculé et payé les congés acquis entre juin 2019 et mai 2020. Le contrat se termine le 31 août, vous devez donc encore payer les congés acquis entre juin 2020 et la fin de contrat.
Mais avant il faut calculer la régularisation éventuelle de la mensu.